La Iglesia de Santa María está situada en el centro de Gernika, cerca de la Casa de Juntas. Construida en el siglo XV, el edificio religioso combina diferentes estilos arquitectónicos como el gótico y el renacentista. Construida en piedra y mampostería, la iglesia consta de tres naves con semicúpulas y una bóveda de crucería gótica realizada por el cantero cántabro Antonio Ortiz. Se eleva sobre ocho elegantes columnas clásicas jónicas y en su interior se halla un riguroso coro renacentista en el que se encuentra un órgano Walcker de 1889. Posee también un magnífico carillón en el campanario barroco de tres cuerpos de 1775. Es interesante la estructura de jambas y arquivoltas con imágenes talladas de santos que rodean la entrada. Según la cita que aparece sobre el portal, "Myll et cccc et IXL años Sanch I o de enparan", el maestro de obras Sancho de Emparan fue el responsable de la construcción en 1449.